CALPI tiene como misión ofrecer asesoría legal y técnica a los pueblos indígenas y comunidades afro descendientes o étnicas de Nicaragua principalmente a las de las Regiones Autónomas de la Costa Caribe en todos sus asuntos para que ejerzan sus derechos; principalmente lo relacionados al ejercicio de sus derechos de propiedad sobre sus tierras y recursos naturales. Derechos que están en profunda relación con el libre ejercicio de su organización comunal, la elección de sus autoridades tradicionales, al uso de su lengua, al respeto de su derecho consuetudinario, al desarrollo de su cultura y autodeterminación.
La Constitución Política de la República de Nicaragua y el Estatuto de Autonomía de las Regiones de la Costa Caribe de Nicaragua (Ley No. 28), Ley del Régimen de Propiedad Comunal de los Pueblos Indígenas y Comunidades Étnicas de las Regiones Autónomas de La Costa Atlántica de Nicaragua y de los Ríos Bocay, Coco, Indio y Maíz (Ley No. 445) forman el marco de los derechos sui generis de estos pueblos indígenas y afro descendientes. La demanda de su observancia, la divulgación y la difusión de estos derechos son esenciales. La presentación de demandas ante los tribunales de justicia de Nicaragua y ante la Comisión Interamericana de Derechos Humanos (CIDH) frente a las violaciones de los derechos de estos pueblos, la divulgación de los derechos a su lengua, cultura, tierras comunales o territorios, recursos naturales, derecho consuetudinario y autodeterminación, debe llegar a los pueblos indígenas y afro descendientes, los funcionarios públicos y al resto de la sociedad, para que sean efectivamente aplicados; por lo que programas de capacitación a líderes indígenas, a funcionarios estatales, regionales, jueces, abogados, estudiantes y a la sociedad civil en general, son impartidos por CALPI para lograr tal fin. Publicaciones en la Pagina Web, Facebook, programas radiales y la impresión de material didáctico e informativo sobre estos derechos son también elaborados y facilitados a los diferentes actores sociales e institucionales. Y la firma de convenios de cooperación con las universidades locales y nacionales están siendo implementados para educar a los estudiantes y profesores en el conocimiento de los derechos de los pueblos indígenas.
